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科學家開發(fā)一種新型微生物群體單細胞分辨率高通量空間轉錄組分析技術

    近日,美國加州理工學院研究團隊開發(fā)了一種新的高通量空間轉錄組成像方法——并行連續(xù)熒光原位雜交par-seqFISH(parallel sequential fluorescence in situ hybridization)技術,能夠在單細胞水平鑒定和觀察微生物基因表達譜和微尺度環(huán)境中的空間信息,同時利用成像系統(tǒng)對不同菌落核仁長度、染色體拷貝和核糖體水平等生長指標進行監(jiān)測。

    研究人員利用par-seqFISH對銅綠假單胞菌的生物膜形成過程進行了研究,證實其能夠解析菌群在浮游生長狀態(tài)下代謝和毒性相關基因轉錄水平的動態(tài)變化,以及固著生長過程(生物膜)中在空間水平上的代謝異質性,揭示了微生物種群在微環(huán)境空間中存在的復雜動態(tài)。研究結果表明par-seqFISH技術能夠為微生物動態(tài)變化與生長調控機制研究提供了新的工具,并為抗菌藥研發(fā)及抗生素耐藥性研究提供新的視角。

    相關研究成果發(fā)表在《Science》雜志上,論文標題為“Spatial transcriptomics of planktonic and sessile bacterial populations at single-cell resolution”

    論文鏈接:https://doi.org/10.1126/science.abi4882

    注:此研究成果摘自《Science》雜志,文章內容不代表本網站觀點和立場,僅供參考。
 

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